Ейск обладает мягким лечебным климатом и морским ионизированным воздухом, а пологое песчаное дно Ейского лимана и Таганрогского залива делают это место идеальным для отдыха с детьми. Из-за мелководности моря вода летом пригревается до +27°С. Пляжи песочные, ракушечные и галечные, шириной от 10 до 50 метров. Летом штормы бывают редко, зной смягчается мягкими бризами.

Осадков выпадает около 440 мм в год. В Ейске лето очень теплое, средняя температура самого жаркого месяца - июля - 24°С. Влажность в городе относительная - около 60%. Летний зной смягчают морские бризы. Купальный сезон длится на курорте с мая по сентябрь-октябрь, температура колеблется от 19°С до 25°С. Зима умеренно мягкая. Средняя температура января - около 4°С.

Осень - теплая и ясная. Весной характерна солнечная, ветряная погода. Соленость Азовского моря в районе города до 10 промилле, это очень низкий показатель. Поэтому зимой море замерзает. В ветряную погоду волны поднимают со дна взвесь из лечебной грязи, залежей которой особенно много в районе так называемого Ейского необитаемого острова. Море становится мутным, а по сути - лечебным.

Целебные грязи и минеральные источники делают Ейский район одним из лучших бальнеологических и грязевых курортов на Азовском море. Отдых в Ейске показан лицам с заболеваниями сердечно-сосудистой системы, опорно-двигательного аппарата, нервной системы, кожными и гинекологическими заболеваниями. В районе открыты несколько источников сероводородных, азотно-метановых, хлоридно-натриевых и йодо-бромных вод, применяемых для ванн. На всех курортах края используется лечебная иловая грязь соленого Ханского озера.